深圳BD空间转录组技术支持

烈冰提供空间转录组全流程服务，包括样本包埋、贴片、选片、HE染色、拍照成像、组织透化、建库测序以及后续的FISH验证等各个步骤，为您提供无忧服务。烈冰搭建了以莱卡CM1950冷冻切片机、尼康多荧光通路全自动扫描显微镜、3Dhistech-midi数字扫描仪为基础的先进实验平台，并制定严格规范的实验室SOP，经过大量的切片、贴片实操演练，对不同类型组织的切片厚度、温度进行优化，确保获得更好质量的冷冻切片。利用NovelBrain云分析平台，搭建0代码需求的空间转录组分析流程，准确快速解析空间转录组数据。取同一样本组织的相邻区域进行单细胞转录组测序，通过单细胞转录组数据和空间转录组数据的整合分析，判定空间区域内的细胞类别，精确解析组织空间内的异质化信息。烈冰科技已建立了基于空间转录组的高通量测序实验多平台。深圳BD空间转录组技术支持

空间组测序技术，作为现阶段单细胞技术的重要补充技术进入了组学的实验领域以及生物信息学的分析领域。通过单细胞测序（单细胞表达尺度）+空间转录组测序（空间表达尺度）+数字病理（临床诊断尺度）联合分析可在空间和时间上描述不断演变的组织生态系统，多角度深入分析组织的形态特征、基因组学特征、表观遗传调控因子以及样本中的免疫微环境。不同于单细胞测序分析的需求-分析-需求-分析的模式，空间转录组分析实际上是非常需要研究者和企业之间的互动的，尤其是对于组织切片的理解，一个在线互相交流空间转录组测序结果的系统也是空转分析中不可或缺的一环，也是重中之重。苏州烈冰生物空间转录组测序服务烈冰引进国际主流空间转录组测序平台，提供保留组织内部精细区域的空间信息的转录组测序。

空间组学可以应用的方向：1.可以鉴定到疾病的空间位置异质性：对于阿尔茨海默症的研宄可以探索到小神经质细胞趋向于阿尔茨海默神经班。 2．建立空间转录组图谱构建个人空间转录组图谱将极大提升科研人员对生物体组织间的细胞差异。3、描述胚胎发育及空间蓝區胚胎发育的动态过程是科研人员一直为之着迷的，空间组学发展可以清晣的描绘胚胎发育的蓝图。除了皮肤、胰腺和骨头组织外，其余样本类型均可开展10xGenomics空间转录组研究。10xGenomics公司已经测试完毕的组织类型有：人：心胜、肾胜、卵巢、乳房、淋巴结、大脑、大肠、肺、脾脏小鼠：大脑、眼睛、心胜、肾胜、大肠、肝脏、肺、卵巢，四头肌、小肠、脾胜、胃、翠丸、甲状腺、舌头大鼠：大脑、肾脏、心脏

10xGenomics空间转录组用于文库构建的每张载玻片上有四个捕获区域，每个捕获区域的大小为6.5x6.5mm，包含5000个被条形码标记的点（barcodedspots），每个点的直径为55μm，点和点之间中心的距离为100μm，并且每个点都有一个barcode序列。组织切片的细胞中会释放出mRNA，迁移到每个spot的mRNA会被标记上相应的barcode序列，然后进行文库构建并进行测序。根据数据的条形码信息对数据进行分析，以确定哪些数据来自哪个位置，从而实现空间基因表达的可视化。空间转录组测序因其强大的探究疾病--细胞--基因的关系，一度成为高通量测序技术的“天花板”。

生命科学研究的目的之一就是为了解决细胞和组织以及该组织如何影响功能这一难题。测序技术可提供特定条件下某些 组织中基因的表达信息，不仅可以推断出相应未知基因的功能，揭示特定调节基因的作用机制，而且可以辨别细胞的类型和异质性，为疾病诊断提供理论依据。但由于研究的深入或具体研究方向和内容的不同，传统的转录组测序技术显然不能够满足科研工作者们强烈的好奇心，更加直观地反映组织中基因的表达情况，随即单细胞转录组测序（Single-cell RNA-sequencing，scRNA-seq）、空间转录组（Spatial transcriptomics，ST）测序等一系列技术应运而生。测序可准确地分析基因表达差异、基因结构变异、筛选分子标记（SNPs或SSR）等生命科学重要问题。杭州烈冰生物空间转录组测序服务

空间转录组可展示组织切片中不同区域的基因表达情况，揭示精细病理区域的信号通路。深圳BD空间转录组技术支持

多样本数据合并：FractionofReadsKept：合并样本时，各样本根据MappedBarcodedReadsperCell数量计算出来的数据利用率。如果各样本间该参数值相差很大，需要进行Downsample处理，以数据量少的样本为基准将不同样本中细胞测序深度标化到同一水平，从而避免因测序深度差异导致的基因检测数量、基因表达水平的差异。烈冰科技自主研发的单细胞云平台致力于帮助每一位客户定制化分析数据，深入解读数据分析结果，深入挖掘其背后的生物学意义；从操作便捷、结果可视化、分析可追溯、系统稳定等方面助力单细胞研究，加速科研进程！深圳BD空间转录组技术支持

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